公司注冊完成后，不是說簡簡單單的就額可以掙到錢，公司的整體運(yùn)營中，不僅僅需要注意對公司內(nèi)部員工的管理，還需要注意對公司的一些經(jīng)經(jīng)營事項(xiàng)把握，否則不僅可能會存在一些稅務(wù)上的風(fēng)險，還可能會影響到公司的整體運(yùn)營，那么對于公司注冊后，在運(yùn)營中，哪些問題會影響到公司呢？一起來和君林小編看看。

一、私戶發(fā)放工資

有的企業(yè)朋友以為通過現(xiàn)金支付，或者個人私戶對公司的員工去支付工資，可以避免企業(yè)的員工繳納個人所得稅，同時也避開稅務(wù)部門的監(jiān)督。其實(shí)這種方法是錯誤的，現(xiàn)在銀行與稅局的數(shù)據(jù)庫進(jìn)行了鏈接，也就是說不管你用什么賬戶，最終都會很輕松被查出來的，如果情節(jié)嚴(yán)重是肯定會有處罰的。

二、發(fā)票扣除異常

企業(yè)的正常抵稅項(xiàng)目，主要就是通過納稅是的稅前抵扣，也就導(dǎo)致了許多的企業(yè)主開始通過虛報自身的營業(yè)費(fèi)用，但是如果長期，或者過多的購買這類發(fā)票，在稅局的大數(shù)據(jù)稽查下，是非常容易讓企業(yè)的問題暴露的，最終受到嚴(yán)厲的處罰。

三、個人補(bǔ)貼不申報

許多企業(yè)有意無意地獨(dú)立計算給予雇員的補(bǔ)貼，如膳食補(bǔ)貼、電話費(fèi)補(bǔ)貼、房間補(bǔ)貼和其他補(bǔ)貼，而不是將其并入工資，以免被納入個人稅收的范圍。然而這種操作是明確規(guī)定需要納入的，到時就很可能導(dǎo)致企業(yè)受到處罰。

四、公司逾期記賬報稅

公司逾期做賬報稅或者逾期交稅等，這種情況是最嚴(yán)重的也是最大幾率發(fā)生的稅務(wù)異常的一種方式，自然稅局也會鎖死公司的電子稅務(wù)局，只能去稅局的辦公地進(jìn)行報稅，解除了異常才能再行使用。

公司的經(jīng)營并不簡單，特別是現(xiàn)如今，稅務(wù)部門的大數(shù)據(jù)的稽查下，再加上金稅三期的上線。不僅企業(yè)各個方面會有所監(jiān)視，還會對企業(yè)的上下游企業(yè)、關(guān)聯(lián)企業(yè)有所統(tǒng)計，只要企業(yè)關(guān)系鏈中，某家企業(yè)出現(xiàn)問題， 整個關(guān)系鏈都可能會被稽查。